В рамках САЕ 2 Первый МГМУ создает междисциплинарную площадку с участием представителей научного, медицинского и образовательного сообществ, для борьбы со сложными социально значимыми заболеваниями и повышения качества жизни людей. Помимо фундаментальных исследований, САЕ 2 будет развивать трансляционные исследования, и разрабатывать технологии практического применения современных достижений науки. Также, в рамках данной САЕ будет осуществляться подготовка исследовательских кадров по направлениям: Медицинская биофизика, Медицинская биохимия, Биоинженерия и биоинформатика, Биотехнологии и др.
С целью развития научно-исследовательского потенциала в рамках САЕ 2 на конкурсной основе будут созданы новые лаборатории и исследовательских центры по приоритетным направлениям научно-исследовательской деятельности. В рамках САЕ 2 будут интенсивно развиваться партнерские отношения с российскими и зарубежными вузами и высокотехнологичными компаниями.
Основой для создания САЕ 2 стали существующие структурные подразделения университета: НИИ молекулярной медицины, НИИ Фармации, НИИ уронефрологии и репродуктивного здоровья человека, Факультет Фармации в 2016 году будут трансформированы в новые:
В рамках САЕ 2 будет создан Научно-образовательный центр «Трансляционная медицина» для консолидации управления САЕ и реализации междисциплинарных научно-образовательных проектов. К 2020 году будет сформирован международный кластер «Трансляционная медицина» с привлечением ведущих академических и научных организаций для развития в рамках данного направления.