В 2015 году кафедра отметила свое 85-летие.
Кафедра всегда преподавала весь курс хирургии, начиная с ухода за хирургическими больными, общую хирургию и хирургические болезни (факультетский и госпитальный курс).
Основатель кафедры профессор В.Р. Хесин имел значительный опыт работы в клинике социальных болезней Московского университета и в хирургическом отделении Института по изучению профессиональной патологии и социально-гигиенического направления в хирургии. Научное работа вновь организованной кафедры была посвящена анализу причин производственного травматизма, его предупреждению, лечению травм и их последствий, профилактике профессиональных хирургических заболеваний, разработке социальных и организационных вопросов хирургической помощи.
Большое практическое значение имели работы по экспертизе трудоспособности, позволившие научно обосновать сроки временной нетрудоспособности после ряда хирургических заболеваний, которые приняты в настоящее время в качестве нормативных актов.
В 1946 г. на должность заведующего кафедрой был избран профессор Ф.Ф. Андреев. Им опубликована 41 научная работа по организации медицинской службы Военно-морского флота.
Под руководством А.Н Великорецкого, руководившего кафедрой с 1951 по 1961 гг., получили дальнейшее развитие традиции профилактического направления научных исследований – изучение проблем общей и частной хирургии, онкологии, гнойной инфекции, антибиотикотерапии, травматологии, продолжались работы по проблеме нарушения белкового обмена у хирургических больных, изучались гемодинамические нарушения при хирургических вмешательствах на органах брюшной полости, велись исследования в области практического применения антикоагулянтов непрямого действия при тромбофлебите.
Дальнейшее изучение проблем профилактики в хирургии в течении 18 лет проводилось под руководством члена-корреспондента АМН СССР, заслуженного деятеля науки РСФСР, профессора А.Н. Шабанова. В этот период продолжалось изучение сельскохозяйственного травматизма и путей его снижения, проведено исследование по профилактике осложнений микротравм кисти у рабочих горнорудной промышленности, дана оценка роли диспансеризации больных облитерирующим эндартериитом нижних конечностей в ряде отраслей производства, была создана лаборатория клинической ангиологии, где проводилось углубленное изучение этой патологии.
В 1979 г. заведующим кафедрой избран профессор В.Г. Рябцев. Кафедра продолжала разработку профилактического направления в хирургии. С этой целью коллектив кафедры вел исследования в двух направлениях: первое – выявление ранних форм хирургических заболеваний и их радикальное лечение в стадии компенсации, второе – разработка мероприятий по профилактике послеоперационных осложнений. Для раннего выявления хирургических заболеваний были разработаны программы профилактических осмотров и диспансеризации, выявление групп риска среди рабочих строительных профессий.
С 1994 по 2014 гг. кафедрой руководил профессор Е.М. Липницкий. Приоритетные направления научных исследований включали: лечение критической ишемии нижних конечностей и осложненного течения хронической венозной недостаточности; профилактику рецидива кровотечений из пептических язв; изучение процессов холелитогенеза на молекулярном уровне и их регулирование; исследование морфофункциональных особенностей апудоцитов у больных пептической язвой; влияние эрадикационной терапии на репаративные процессы в культе желудка и области гастроэнтероанастомоза у больных, перенесших резекцию желудка; разработку математической модели прогноза возникновения кровотечения и его рецидива у больных пептической язвой, а также способов профилактики рецидива кровотечения из пептических язв после гемостаза; изучение эффективности эндоскопической аппликации на язву коллагенового препарата «Тромбокол» при кровоточащей пептической язве; исследование чувствительности тестов диагностики хеликобактериоза и эффективности различных схем эрадикационной терапии у больных кровоточащей пептической язвой; изучение качества жизни больных после аллопластики больших и гигантских послеоперационных вентральных грыж; сравнение отдаленных результатов лечения больных варикозной болезнью нижних конечностей после традиционного и современных методов лечения; исследование ближайших и отдаленных результатов «ненатяжной» пластики паховых грыж; исследование особенностей течения послеоперационного периода и системного воспалительного ответа у больных желчнокаменной болезнью, перенесших однопортовую лапароскопическую холецистэктомию; изучение проблем дисбиоза кишечника и его роль в развитии осложнений при операциях на толстой кишке, при механической желтухе, в развитии рака толстой кишки; разработку профилактики рака молочной железы и др.
Научная группа при кафедре изучала роль нарушения микроциркуляции в течении травматического и геморрагического шока, при кровотечении, вопросы коррекции этих нарушений.
Кафедра сотрудничала с Институтом медико-биологически проблем (изучение микроциркуляции), СГУ им. Чернышевского (математическое моделирование сосудистого русла), с СГМУ (изучение поведения сосудистой стенки в норме и при патологии), ООО «ИТ-ДИАЛОГ» (визуализация биологических объектов), ООО «ФАРМАПАРК» (изучение влияния увеличения емкости крови на течение ишемии органов и тканей»).
В 2015 г. на должность заведующего кафедрой избран профессор Н.Н. Крылов.В 2017 году кафедра хирургии была объединена с кафедрой колопроктологии и эндоскопической хирургии ИПО, в результате чего были сохранены лучшие стороны обеих коллективов - академические знания и практические навыки, основы хирургии и высокие технологии. Заведующим кафедрой стал профессор П.В. Царьков.
В 2019 году кафедра хирургии МПФ была переведена в Институт клинической медицины (бывший лечебный факультет).