История стоматологического образования в Сеченовском университете началась еще в 1885 году, когда по инициативе Н.В. Пирогова на базе медицинского факультета Московского университета была создана приват-доцентура по одонтологии. Автором курса и составителем учебной программы стал Н.Н. Знаменский. С 1905 года практические занятия по одонтологии в университете вместе с Н.Н. Знаменским вели доктор медицины, профессор Г.И. Вильга и доктор медицины, приват-доцент по курсу «Болезни зубов и полости рта» М.Б. Янковский. До создания стоматологического факультета стоматологию студентам лечебного факультета преподавали в виде курса на кафедре челюстно-лицевой хирургии. В разное время руководителями кафедры были великие врачи и ученые, профессора Н.Н. Знаменский, Г.И. Вильга, Л.А. Говсеев, И.Г. Лукомский, И.М. Старобинский, доцент Т.Н. Соколова. С 1962 по 2006 г. кафедрой бессменно руководил д.м.н., профессор, академик РАМН Бажанов Николай Николаевич, который и выступил с инициативой создания стоматологического факультета. Приказ о создании стоматологического факультета в стенах ММА им. И.М. Сеченова был подписан 27 апреля 2001 года. Первым деканом стоматологического факультета стала д.м.н., профессор Н.С. Подчерняева.
Первой профильной кафедрой, принявшей студентов в 2001 году, стала кафедра терапевтической стоматологии под руководством профессора Ирины Михайловны Макеевой. Большой вклад в развитие факультета внес профессор кафедры терапевтической стоматологии Евгений Власович Боровский, выдающийся деятель науки, врач, преподаватель, по учебникам которого учились и продолжают учиться многие поколения врачей-стоматологов. По мере развития факультета начинали работу и другие профильные кафедры. Кафедра стоматологии детского возраста и ортодонтии под руководством д.м.н., профессора Адиля Аскеровича Мамедова основана в 2002 году. Кафедра хирургической стоматологии под руководством профессора Сысолятина Святослава Павловича была основана в 2004 году на базе общего стоматологического отделения №2 Клинико-диагностического центра Первого МГМУ им. И.М. Сеченова. Кафедра ортопедической стоматологии была организована в 2010 году путем преобразования курса ортопедической стоматологии, первым заведующим кафедрой стал д.м.н., профессор Сергей Викторович Козлов. Кафедра пропедевтики стоматологических заболеваний была основана в январе 2011 года под руководством д.м.н., профессора Севбитов Андрей Владимировича. В 2014 г. была создана кафедра профилактики и коммунальной стоматологии под руководством д.м.н., профессора Олег Иванович Адмакина.
В декабре 2017 года стоматологический факультет был преобразован с Институт Стоматологии, основной базой которого стал Стоматологический центр клинического центра Сеченовского университета на Можайском валу. Стоматологические клиники (объединение кафедры и отделения) в здании на Можайском валу являются уникальным комплексом, позволяющим пациентам получить самый современный и надежный способ лечения с минимальными рисками, а обучающимся приобрести глубокие знания, клинический опыт и навыки научно-исследовательской работы совместно с сотрудниками Института стоматологии.
В настоящее время Институт стоматологии имени Е.В. Боровского является высококвалифицированным стоматологическим учреждением, на базе которого осуществляется лечебная, образовательная и научно-исследовательская деятельность. Это позволяет нам формировать современные инновационные принципы оказания медицинской помощи через научно-исследовательскую деятельность, при этом обучая новое поколения врачей. Наши выпускники занимают лидирующие позиции в стоматологических клиниках, а врачи и преподаватели являются ведущими специалистами в стоматологическом сообществе.