Помимо педагогической работы сотрудники кафедры детской хирургии и урологии-андрологии ведут научно-исследовательскую деятельность. Всего на кафедре работает восемь педагогов. Приоритетные направления научной работы кафедры - "Детская колопроктология" и "Детская урология".