Организаторы IV Сеченовского хакатона по биоинформатике и клинической онкологии подвели итоги мероприятия. Результаты были объявлены на VIII Сеченовском международном биомедицинском саммите «Научно-технологическая кооперация в медицинской отрасли» (SIBS-2024), проведенном в рамках программы создания и развития НЦМУ «Цифровой биодизайн и персонализированное здравоохранение» при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ.

«В этом году наши исследования были посвящены химерным онкогенам. Сегодня они привлекают особое внимание, существуют препараты, которые на них воздействуют. Но выявление химерных онкогенов требует гораздо более сложной работы, чем стандартное секвенирование — необходимы биоинформатические подходы. Поэтому необходима разработка новых методов, подходящих для применения в клинической практике», – рассказала директор Института персонализированной онкологии Сеченовского Университета Марина Секачева.

Хакатон проводился онлайн. Заявки на него подали 90 человек со всех уголков страны. Из них организаторы отобрали 27 наиболее перспективных участников, которых разделили на три команды.

Под руководством научных сотрудников Института персонализированной онкологии участники на протяжении двух дней искали ответы на следующие фундаментальные научные вопросы:

   

— Какие химерные гены с какой частотой находятся в новой экспериментальной базе опухолевых транскриптомов российских онкобольных РОНИН?

— Какие из них произошли в результате геномных перестроек, а какие стали продуктами сквозной транскрипции?

— Насколько различается состав химерных генов в опухолевых базах РОНИН и TCGA?

— Гены, несущие какие функции, оказываются 5’- и 3’-партнерами в опухолевых химерах?

Лучше всех с задачами справилась команда под руководством научного сотрудника Института персонализированной онкологии Марианны Золотовской. Полученные результаты лягут в основу одной или нескольких научных статей, которые потом будут отправлены в ведущие тематические научные журналы. По итогам прошедших хакатонов опубликованы уже четыре статьи, еще одна готовится к публикации. Кроме того, лучшие участники получили рекомендации к трудоустройству в институты НЦМУ «Цифровой биодизайн и персонализированное здравоохранение».