Ученые Сеченовского Университета в сотрудничестве с российскими и зарубежными коллегами опубликовали фундаментальное руководство по современным методам транскриптомного анализа — Handbook of Translational Transcriptomics: Research, Protocols and Applications. Это первое издание, охватывающее весь спектр ключевых методик и прикладных решений в одной из самых стремительно развивающихся областей биомедицины. Главным редактором и соавтором книги выступил главный научный сотрудник Института персонализированной онкологии Сеченовского Университета профессор РАН Антон Буздин, также в список соавторов вошла директор Института персонализированной онкологии Марина Секачева.

Издание систематизирует знания, накопленные за более чем два десятилетия развития транскриптомики — науки, изучающей экспрессию генов на уровне РНК. Особое внимание уделено трансляционным аспектам: как с помощью транскриптомного анализа решать задачи клинической диагностики, подбора терапии, мониторинга эффективности лечения и поиска новых терапевтических мишеней.

«Handbook of Translational Transcriptomics — первое международное издание, которое настолько системно охватывает весь спектр современных методов транскриптомного анализа от фундаментальных принципов до практических приложений в персонализированной медицине. Оно призвано стать настольным пособием для исследователей, клиницистов и биоинформатиков, обеспечивая их всем необходимым для интерпретации транскриптомных данных и внедрения этих решений в практику, в том числе в клинику», — подчеркивает Антон Буздин.

Руководство охватывает все этапы работы — от лабораторной подготовки образцов до интерпретации данных и их внедрения в клиническую практику. Представлены как базовые протоколы лабораторных исследований (тотальное РНК-секвенирование, секвенирование РНК одиночных клеток, пространственная транскриптомика, рибосомальное профилирование), так и современные биоинформатические подходы к интерпретации результатов. В их числе — разработанные под руководством Антона Буздина алгоритмы Oncobox и iPANDA, которые позволяют по экспрессии генов оценивать активность молекулярных путей и подбирать персонализированные схемы терапии.

Отдельные главы посвящены алгоритмам предсказания эффективности противоопухолевых препаратов, интерпретации данных с учетом пространственного распределения транскриптов в ткани, подходам к оценке качества биомаркеров, а также интеграции транскриптомики с другими омиксными дисциплинами, в частности протеомикой и метаболомикой.

Книга ориентирована на исследователей, студентов, врачей и специалистов в области молекулярной диагностики и персонализированной медицины. Она может стать настольным пособием для всех, кто работает на стыке биологии, цифровых технологий и клинической практики и стремится использовать молекулярные данные для улучшения качества медицинской помощи.