Завершилась Летняя школа «Большие данные в медицине» Сеченовского Университета Минздрава России. Более 30 студентов технических и классических вузов освоили навыки работы с большими данными и смогут применять их в практической медицине и науках о человеке. Школа проходит уже второй год – в рамках реализуемого Университетом стратегического проекта «Биодизайн» и программы стратегического академического лидерства «Приоритет 2030».

Тридцать три студента старших курсов из разных городов России и Республики Беларусь прослушали курс лекций от лучших экспертов-практиков, в том числе ведущих преподавателей Сеченовского Университета. На практикумах – научились основам работы с Big Data конкретно для целей медицины. В будущем специалисты с подобными компетенциями смогут развивать в России цифровое здравоохранение, создавать программные решения для врачей и пациентов, разрабатывать сервисы для работы с научно-медицинской информаций, автоматизировать процессы в медицине, которые за человека может выполнять искусственный интеллект. Технологическим партнером Летней школы в этом году выступила компания Yandex Cloud.

Для практической работы участники поделились на три группы – выбрали то, что им наиболее интересно и поможет в дальнейшем образовании. Первой группе показали арсенал техник для работы с биомедицинскими текстами и данными. На примере запроса «Искусственный интеллект» они искали и анализировали информацию, которая хранится на PubMed, одной из крупнейших текстовых баз с медицинскими и биологическими публикациями. Рассказывает модератор группы, руководитель отдела научной аналитики и прогнозирования Департамента научного развития Сеченовского Университета Алина Альшевская: «Каждый день в мире публикуются сотни тысяч медицинских и научных статей – это огромный объем информации, который физически просто невозможно проанализировать. Поэтому сейчас для поиска активно используется искусственный интеллект. Это экономит время врачам-клиницистам, которые хотят знать, что происходит в их области, – помогает понять, про что статья или целый пул статей. И позволяет врачам-исследователям выделить слепую зону – что еще не изучено и куда можно приложить свои силы».

Вторая практическая группа, в которую записались будущие инженеры, биологи и врачи, строила 3D-модели по цифровым медицинским изображениям. Модерировал ее Иван Черненький, ведущий инженер-программист Центра нейросетевых технологий Института урологии и репродуктивного здоровья человека Сеченовского Университета. 3D-модели существуют давно, но раньше врачам приходилось брать в руки линейку и вручную размечать снимки КТ или МРТ. Это долгая и кропотливая работа – одно построение занимает около полутора часов. Теперь за человека это делает искусственный интеллект. К примеру, если речь идет про опухоль, ИИ автоматически выделяет анатомические структуры, а диагност уже оценивает их размеры, определяет, что перед ним – злокачественное или доброкачественное образование, и продумывает траекторию лечения. Если врач решит, что нужна операция, ИИ поможет ему понять, как лучше проводить вмешательство: открытым или закрытым способом, с помощью робота или лапароскопически. 3D-модель можно продемонстрировать пациенту сразу на приеме – наглядно показать, почему лечение нужно провести так, а не иначе.

Третья рабочая группа оптимизировала дозу препарата ипилимумаб, который используют для лечения меланомы. Модератором выступила Анна Мишина, младший научный сотрудник Центра математического моделирования в разработке лекарств Сеченовского Университета. Студенты применяли популяционное моделирование – в виде дифференциальных уравнений описывали процессы, которые происходят в организме человека. В частности, наблюдали, как меняется концентрация ипилимумаба в плазме крови человека в зависимости от уровня эндогенных иммуноглобулинов, который повышается, к примеру, когда ты простудился. Потом с помощью математической модели предсказывали, как препарат поведет себя в той или иной популяции, и определяли оптимальную дозировку.

По итогам каждого из практикумов студенты защитили несколько практических ИТ-кейсов. В финале Летней школы выпускникам вручили сертификат участника. Ребята, которые захотят еще глубже погрузиться в тему, смогут поступить на совместную магистерскую программу Сеченовского Университета и МГУ имени М. В. Ломоносова «Интеллектуальные информационные технологии в медицине».

«Я встретил здесь студентов из разных концов страны. Каждый из них – интересный человек, у которого есть чему поучиться! Мне доверили помогать в модерировании рабочих групп, и это круто – я послушал практикумы сразу по нескольким тематикам, расширил свой кругозор. Теперь буду применять новые знания в учебе». (Егор Деревянко, Институт лингвистики и межкультурной коммуникации Сеченовского Университета, направление «Интеллектуальные системы в гуманитарной сфере», 3-й курс.)

«Я узнала много полезного в области биомедицины, особенно мне понравилось слушать про фармакометрику и эндокринологию. На практике я записалась в группу по препарату ипилимумаб – познакомилась с интереснейшими ребятами и нашим модератором, которая помогала нам на каждом этапе работы. В будущем хочу заняться исследованиями в области онкологии – биоинформатика мне очень пригодится. Спасибо преподавателям по Big Data, что дали мотивацию и возможность развиваться!» (Анастасия Гавриш, Белорусский государственный университет (Минск), специализация «Биотехнология», 3-й курс.)

«Я изучаю большие данные в МИЭТ, и мне было очень интересно пройти эту школу, чтобы получить новые знания и закрепить старые. На практикуме я познакомился с популяционным моделированием – новая для меня методика, которую я смогу переложить на свой учебный процесс. Огромное спасибо Летней школе! И отдельная благодарность преподавателям – за то, что открыты и всегда готовы помочь». (Владислав Новицкий, Московский институт электронной техники (МИЭТ), программа «Биотехнические системы», 4-й курс.)