Аннтотация

Филодинамика крымского конго генотипа V вируса геморрагической лихорадки (CCHFV) на юге России была проанализирована с использованием 244 частичных (452-571 нт) последовательностей во всех трех геномных сегментах и ​​38 полных геномных последовательностей. Несмотря на увеличение числа последовательностей, русская линия европейского генотипа V (обычно называемая GtVa) отличалась от изолятов GtV из Турции и балканских стран. В филогенетической подгруппе CCHFV на юге России географического паттерна не наблюдалось. Идентичные изоляты могут быть обнаружены в отдаленных местах, разнесенных на сотни километров, тогда как в том же регионе циркулируют относительно разные вирусы. Полный анализ генома показал, что события реассортировки в GtVa происходили каждые несколько десятилетий (средний период полураспада нереассортантного узла 30-40 лет) и включали сегменты M и S. Следовательно,