Кафедра инфектологии создана в 1993 г. академиком РАМН С.В.Прозоровским, возглавлявшим ее до 1997 года. С 2000 года кафедру возглавляет лауреат премий Правительства РФ, академик РАН, доктор биологических наук, профессор Александр Леонидович Гинцбург - директор ФГБУ «ФНИЦЭМ им.Н.Ф.Гамалеи» Минздрава России.
В 2012 г. приказом ректора Первого МГМУ им.И.М.Сеченова, путем слияния с кафедрой вирусологии, преобразована в кафедру инфектологии и вирусологии.С декабря 2014 года кафедра инфектологии и вирусологии медико-профилактического факультета вошла в структурное подразделение Института профессионального образования (ИПО).
Функционирование кафедры на базе центра и интеграция ведущего научного центра страны в области медицинской микробиологии в систему последипломного профессионального образования позволяют:
• оперативно включать последние научные достижения в области медицинской микробиологии, эпидемиологии, вирусологии, биотехнологии и инфекционной иммунологии в программу подготовки и переподготовки профессиональных кадров врачей-бактериологов и врачей-вирусологов,
• использовать богатый методический потенциал института, результаты приоритетных фундаментальных исследований в области традиционной и молекулярной диагностики инфекционных болезней при организации учебного процесса, проведении практических занятий,
• внедрять научные методы в организацию педагогического процесса при подготовке государственных образовательных стандартов, руководств, учебных пособий, методических материалов.