Eng
Лаборатория медицинской генетики

Заведующий: д.б.н., проф. Немцова Марина Вячеславовна

E-mail: nemtsova_m_v@mail.ru

Сотрудники:

Главный научный сотрудник, д.б.н., проф. Залетаев Дмитрий Владимирович

Ведущий научный сотрудник, к.б.н. Кузнецова Екатерина Борисовна

Старший научный сотрудник, к.м.н., доц. Михайленко Дмитрий Сергеевич

Старший научный сотрудник, PhD Буре Ирина Владимировна

Старший научный сотрудник, к.б.н. Алексеева Екатерина Александровна

 

Направления научной деятельности:

Основным направлением работы лаборатории является проведение фундаментальных и прикладных научных исследований в области молекулярной генетики человека и биомедицины. Онкогеномика – главное направление проводимых научных исследований. Сотрудники лаборатории изучают молекулярные механизмы канцерогенеза, генетические и эпигенетические изменения в геноме клеток злокачественных опухолей. Основное внимание уделяется поиску и характеристике потенциальных молекулярных маркеров, имеющих диагностическое и прогностическое значение. Область интересов научного коллектива охватывает широкий спектр различных типов опухолей человека: рак желудка, онкоурологические заболевания (рак мочевого пузыря, рак почки, рак предстательной железы), рак молочной железы, рак легкого и другие. Результаты этих исследований позволят повысить качество диагностики и эффективность лечения ряда онкологических заболеваний, предложить новые и дополнить имеющиеся диагностические протоколы.

Еще одним важным направлением исследований является поиск причин мужского и женского бесплодия: характеристика герминальных мутаций, влияющих на течение беременности у женщин и сперматогенез у мужчин, а также полиморфизмов генов, связанных с развитием гонадной дисгенезии при эмбриональном развитии организма.

Немаловажной задачей лаборатории в структуре Сеченовского университета является разработка и применение на практике новых современных программ обучения студентов с учетом последних научных достижений молекулярной генетики человека и геномики. Сотрудники лаборатории регулярно читают лекции и ведут практические занятия со студентами. На базе лаборатории выполняются дипломные проекты и диссертационные работы.

Лаборатория оснащена современным оборудованием: системой для высокопроизводительного секвенирования следующего поколения, капиллярными генетическими анализаторами для секвенирования по Сэнгеру и фрагментого анализа, детектирующими амплификаторами для ПЦР в реальном времени, различными программируемыми термоциклерами для ПЦР и всем необходимым вспомогательным оборудованием.

Все без исключения сотрудники лаборатории имеют ученые степени, в том числе, полученные в зарубежных университетах, являются руководителями или исполнителями по грантам РФФИ и других научных фондов. Коллектив лаборатории непосредственно участвует также в работах по грантам других подразделений Сеченовского университета, реализуя на практике междисциплинарный подход к решению задач вместе с научными и клиническими базами университета.

Основные публикации (статьи за последние 3 года в журналах, индексируемые в Scopus):

1. Alekseeva E.A., Kuznetsova E.B., Tanas A.S., Prozorenko E.V., Zaytsev A.M., Kurzhupov M.I., Kirsanova O.N., Rudenko V.V., Strelnikov V.V., Zaletaev D.V. Loss of heterozygosity and uniparental disomy of chromosome region 10q23.3-26.3 in glioblastoma. Genes Chromosomes Cancer. 2018; 57(1): 42-47.

2. Nemtsova M.V., Strelnikov V.V., Tanas A.S., Bykov I.I., Zaletaev D.V., Rudenko V.V., Glukhov A.I., Kchorobrich T.V., Li Y., Barreto G.E., Aliev G. Implication of gastric cancer molecular genetic markers in surgical practice. Curr Genomics. 2017; 18(5): 408-415.

3. Mikhaylenko D.S., Efremov G.D., Strelnikov V.V., Zaletaev D.V., Alekseev B.Y. Somatic mutation analyses in studies of the clonal evolution and diagnostic targets of prostate cancer. Curr Genomics. 2017; 18(3): 236-243.

4. Dantsev I.S., Ivkin E.V., Tryakin A.A., Godlevski D.N., Latyshev O.Y., Rudenko V.V., Mikhaylenko D.S., Chernykh V.B., Volodko E.A., Okulov A.B., Loran O.B., Nemtsova M.V. Genes associated with testicular germ cell tumors and testicular dysgenesis in patients with testicular microlithiasis. Asian J Androl. 2018; 20(6): 593-599.

5. Mikhaylenko D.S., Alekseev B.Y., Zaletaev D.V., Goncharova R.I., Nemtsova M.V. Structural alterations in human fibroblast growth factor receptors in carcinogenesis. Biochemistry (Mosc). 2018; 83(8): 930-943.

6. Bure I.V., Kuznetsova E.B., Zaletaev D.V. Long noncoding RNAs and their role in oncogenesis. Mol Biol (Mosk). 2018; 52(6): 907-920.

7. Tanas A.S., Sigin V.O., Kalinkin A.I., Litviakov N.V., Slonimskaya E.M., Ibragimova M.K., Ignatova E.O., Simonova O.A., Kuznetsova E.B., Kekeeva T.V., Larin S.S., Poddubskaya E.V., Trotsenko I.D., Rudenko V.V., Karandasheva K.O., Petrova K.D., Tsyganov M.M., Deryusheva I.V., Kazantseva P.V., Doroshenko A.V., Tarabanovskaya N.A., Chesnokova G.G., Sekacheva M.I., Nemtsova M.V., Izhevskaya V.L., Kutsev S.I., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Genome-wide methylotyping resolves breast cancer epigenetic heterogeneity and suggests novel therapeutic perspectives. Epigenomics. 2019. doi: 10.2217/epi-2018-0213.

8. Bure I., Geer S., Knopf J., Roas M., Henze S., Strobel P., Agaimy A., Wiemann S., Hoheisel J.D., Hartmann A., Haller F., Moskalev E.A. Long noncoding RNA HOTAIR is upregulated in an aggressive subgroup of gastrointestinal stromal tumors (GIST) and mediates the establishment of gene-specific DNA methylation patterns. Genes Chromosomes Cancer. 2018; 57(11): 584-597.

9. Baldin A.V., Grishina A.N., Korolev D.O., Kuznetsova E.B., Golovastova M.O., Kalpinskiy A.S., Alekseev B.Y., Kaprin A.D., Zinchenko D.V., Savvateeva L.V., Varshavsky V.A., Zernii E.Y., Vinarov A.Z., Bazhin A.V., Philippov P.P., Zamyatnin A.A. Autoantibody against arrestin-1 as a potential biomarker of renal cell carcinoma. Biochimie. 2019; 157: 26-37.

10. Bure I., Haller F., Zaletaev D.V. Coding and non-coding: molecular portrait of GIST and its clinical implication. Curr Mol Med. 2018; 18(4): 252-259.

11. Ivanova M.E., Trubilin V.N., Atarshchikov D.S., Demchinsky A.M., Strelnikov V.V., Tanas A.S., Orlova O.M., Machalov A.S., Overchenko K.V., Markova T.V., Golenkova D.M., Anoshkin K.I., Volodin I.V., Zaletaev D.V., Pulin A.A., Nadelyaeva I.I., Kalinkin A.I., Barh D. Genetic screening of Russian Usher syndrome patients toward selection for gene therapy. Ophthalmic Genet. 2018; 39(6): 706-713.

12. Mikhaylenko D.S., Prosyannikov M.Y., Baranova A., Nemtsova M.V. Genetic and biochemical features of the monogenic hereditary urolithiasis. Biomed Khim. 2018; 64(4): 315-325.

13. Nemtsova M.V., Ivkin E.V., Simonova O.A., Rudenko V.V., Chernykh V.B., Mikhaylenko D.S., Loran O.B. Polymorphisms of KITLG, SPRY4, and BAK1 genes in patients with testicular germ cell tumors and individuals with infertility associated with AZFc deletion of the Y chromosome. Mol Biol (Mosk). 2016; 50(6): 960-967.

14. Mikhaylenko D.S., Efremov G.D., Sivkov A.V., Zaletaev D.V. Hormone resistance and neuroendocrine differentiation due to accumulation of genetic lesions during clonal evolution of prostate cancer. Mol Biol (Mosk). 2016; 50(1): 34-43.

15. Akselrod E.V., Mironov K.O., Mikhailenko D.S., Efremov G.D., Perepechin D.V., Alekseiev B.Y., Potekhina E.S., Shipulin G.A. The development and approbation of methodology on the basis of multiplex polymerase chain reaction in real-time to determine clinically significant micro-deletion in Y-chromosome. Klin Lab Diagn. 2018; 63(2): 124-128.

16. Tanas A.S., Borisova M.E., Kuznetsova E.B., Rudenko V.V., Karandasheva K.O., Nemtsova M.V., Izhevskaya V.L., Simonova O.A., Larin S.S., Zaletaev D.V., Strelnikov V.V. Rapid and affordable genome-wide bisulfite DNA sequencing by XmaI-reduced representation bisulfite sequencing. Epigenomics. 2017; 9(6): 833-847.

17. Mikhailenko D.S., Zhinzhilo T.A., Kolpakov A.V., Kekeeva T.V., Strelnikov V.V., Nemtsova M.V., Kushlinskii N.E. Specific localization of missense mutations in the VHL gene in clear cell renal cell carcinoma. Bull Exp Biol Med. 2017; 163(4): 465-468.

18. Nemtsova M.V., Ivkin E.V., Tryakin A.A., Rudenko V.V., Dantsev I.S., Tyulyandin S.A., Loran O.B. Genetic risk factors for sporadic germ cell testicular tumors. Urologiia. 2017; 1: 24-30.

19. Mikhailenko D.S., Nemtsova M.V. Point somatic mutations in bladder cancer: key carcinogenesis events, diagnostic markers and therapeutic targets. Urologiia. 2016; 1: 100-105.

20. Osminin S.V., Vetshev F.P., Rudenko V.V., Zaletaev D.V., Khorobrykh T.V., Nemtsova M.V. The molecular genetic alterations in mucosa of intestines as markers of oncologic progression and estimate of effectiveness of anti-reflux operations in patients with Barrett's esophagus. Klin Lab Diagn. 2016; 61(10): 681-685.

21. Mikhailenko D.S., Efremov G.D., Safronova N.Y., Strelnikov V.V., Alekseev B.Y. Detection of rare mutations by routine analysis of KRAS, NRAS, and BRAF oncogenes. Bull Exp Biol Med. 2017; 162(3): 375-378.

22. Golovastova M.O., Tsoy L.V., Bocharnikova A.V., Korolev D.O., Gancharova O.S., Alekseeva E.A., Kuznetsova E.B., Savvateeva L.V., Skorikova E.E., Strelnikov V.V., Varshavsky V.A., Vinarov A.Z., Nikolenko V.N., Glybochko P.V., Zernii E.Y., Zamyatnin A.A., Bazhin A.V., Philippov P.P. The cancer-retina antigen recoverin as a potential biomarker for renal tumors. Tumour Biol. 2016; 37(7): 9899-9907.

23. Mikhailenko D.S., Kushlinskii N.E. The somatic mutations and aberrant methylation as potential genetic markers of urinary bladder cancer. Klin Lab Diagn. 2016; 61(2): 78-83.

24. Saakyan S.V., Tsygankov A.Y., Amiryan A.G., Sklyarova N.V., Zaletaev D.V. Role of molecular and genetic factors in survival from uveal melanoma. Vestn Oftalmol. 2016; 132(1): 3-9.

25. Knyazev E.N., Fomicheva K.A., Mikhailenko D.S., Nyushko K.M., Samatov T.R., Alekseev B.Y., Shkurnikov M.Y. Plasma levels of hsa-miR-619-5p and hsa-miR-1184 differ in prostatic benign hyperplasia and cancer. Bull Exp Biol Med. 2016; 161(1): 108-111.

26. Shikeeva A.A., Kekeeva T.V., Zavalishina L.E., Andreeva Y.Y., Zaletaev D.V., Frank G.A. Expression of microRNA let-7a, miR-155, and miR-205 in tumor and tumor-adjacent histologically normal tissue in patients with non-small cell lung cancer. Arkh Patol. 2016; 78(3): 3-10.

27. Shkurnikov M.Y., Knyazev E.N., Fomicheva K.A., Mikhailenko D.S., Nyushko K.M., Saribekyan E.K., Samatov T.R., Alekseev B.Y. Analysis of plasma microRNA associated with hemolysis. Bull Exp Biol Med. 2016; 160(6): 748-750.

28. Olisova O.Y., Grekova E.V., Varshavsky V.A., Gorenkova L.G., Alekseeva E.A., Zaletaev D.V., Sydikov A.A. Current possibilities of the differential diagnosis of plaque parapsoriasis and the early stages of mycosis fungoides. Arkh Patol. 2019; 81(1): 9-17.

29. Михайленко Д.С., Сергиенко С.А., Заборский И.Н., Сафиуллин К.Н., Серебряный С.А., Сафронова Н.Ю., Немцова М.В., Каприн А.Д., Алексеев Б.Я. Роль молекулярно-генетических изменений в прогнозе эффективности адъювантной внутрипузырной терапии немышечно-инвазивного рака мочевого пузыря. Онкоурология. 2018; 14(4): 124-138.

30. Михайленко Д.С., Алексеев Б.Я., Ефремов Г.Д., Каприн А.Д. Генетические особенности несветлоклеточного рака почки. Онкоурология. 2016; 12(3): 14-21.

31. Ковалева О.В., Ефремов Г.Д., Михайленко Д.С., Алексеев Б.Я., Грачев А.Н. Роль макрофагов, ассоциированных с опухолью в патогенезе почечно-клеточного рака. Онкоурология. 2017; 13(1): 20-26.

32. Немцова М.В., Данцев И.С., Михайленко Д.С., Лоран О.Б. Генетические аспекты синдрома тестикулярной дисгенезии и составляющих его состояний. Онкоурология. 2018; 14(3): 92-106.

33. Михайленко Д.С., Телешова М.В., Перепечин Д.В., Ефремов Г.Д., Качанов Д.Ю., Райкина Е.В., Бобрынина В.О., Лаврина С.Г., Митрофанова А.М., Коновалов Д.М., Варфоломеева С.Р., Алексеев Б.Я. Герминальные нонсенс-мутации в гене SMARCB1 у российских пациентов с рабдоидными опухолями почек. Онкоурология. 2017; 13(2): 14-19.

34. Михайленко Д.С., Новиков А.А., Григорьева М.В., Ефремов Г.Д., Сивков А.В., Сафронова Н.Ю., Сорокин К.С., Земскова М.Ю., Немцова М.В., Алексеев Б.Я., Каприн А.Д. Сравнение экспрессии гена РСА3 в осадках и экзосомах мочи при раке предстательной железы. Онкоурология. 2017; 13(3): 54-60.

Монографии (опубликованные за последние 3 года):

1. Генетика в практике хирургического лечения рака желудка. А.Ф. Черноусов, Т.В. Хоробрых, М.В. Немцова, И.И. Быков. – Москва: Практическая медицина, 2017, 128 стр.

2. Михайленко Д.С., Алексеев Б.Я., Каприн А.Д. Глава 1. Молекулярно-биологические основы патогенеза и генетические основы рака мочевого пузыря. «Рак мочевого пузыря» под ред. М.И. Когана. – М.: Медфорум. 2017. – 262 стр. - С. 10-21.

3. Немцова М.В. Глава 1. Молекулярно-биологические характеристики злокачественных новообразований; Глава 4. Опухолевая клональность. «Биологические маркеры опухолей: фундаментальные и клинические исследования» / под ред. Н.Е. Кушлинского, М.А. Красильникова. – М.: Изд-во РАМН, 2017. С. 20-65, 120-141.

4. Михайленко Д.С., Алексеев Б.Я., Каприн А.Д. Глава 2. Молекулярная генетика рака предстательной железы. «Рак простаты: от протеомики и геномики к хирургии» / под ред. М.И. Коган, Д.Ю. Пушкарь. – Ростов н/Д: Изд-во ЮНЦ РАН, 2017, С. 34-42.

5. Немцова М.В. Глава 5. Клинико-молекулярные аспекты канцерогенеза желудка; Глава 10. Молекулярно-генетическая патология при раке мочевого пузыря; Глава 12. Молекулярно-генетические аспекты герминогенных опухолей яичка. «Молекулярно-генетические маркеры опухолей» / под ред. Н.Е. Кушлинского, Н.Н. Мазуренко и М.В. Немцовой. – М.: Изд-во РАМН, 2016. С. 173-200, 366-416, 455-469.

6. Михайленко Д.С. Глава 11. Молекулярно-генетические нарушения при раке предстательной железы. «Молекулярно-генетические маркеры опухолей» / под ред. Н.Е. Кушлинского, Н.Н. Мазуренко и М.В. Немцовой. – М.: Изд-во РАМН, 2016. С. 417-444.