Кафедра эпидемиологии и доказательной медицины Первого МГМУ им. И.М. Сеченова имеет богатую историю. Как самостоятельная кафедра она была организована в Московском медицинском институте в 1931 году. В 20–30-е годы XX века широкая сеть практических санитарно-противоэпидемических учреждений постоянно испытывала потребность в новых специалистах. В этих условиях одной из важнейших задач национального здравоохранения стала подготовка квалифицированных кадров в области санитарно-эпидемиологического дела. Основателем и первым руководителем кафедры эпидемиологии в Московском медицинском институте был профессор Н.Н. Клодницкий, один из крупнейших отечественных эпидемиологов.
В 1933 г. кафедра получила помещение в здании бывшего Института социальной гигиены, оборудование санитарной станции Фрунзенского района, приобрела микроскопы и другие пособия, необходимые для проведения занятий со студентами. Затем кафедра переехала во вновь отстроенное здание Института гигиены на Девичьем Поле, вступившего в эксплуатацию в 1936 г. Корпус, куда были переведены кафедры санитарно-гигиенического факультета, представлял собой трехэтажную надстройку над одноэтажным зданием, построенном в 1890 г. Ф.Ф. Эрисманом.
В 1935 году на кафедре эпидемиологии был создан студенческий научный кружок, а вскоре при кафедре была создана бактериологическая лаборатория, которая превратилась в современную базу для научных работ кафедры.Работа в студенческом кружке расширяла кругозор студентов, углубляла их знания в области эпидемиологии и облегчала отбор кандидатов в аспирантуру. Почти все аспиранты кафедры были в прошлом активными участниками студенческого научного кружка. Также из кружковцев отбирались лучшие студенты для продолжения постдипломного обучения в интернатуре и ординатуре.
С момента возникновения кафедры на ней постоянно велась большая методическая работа. Еще в 1936 г. было разработано много частных методик отдельных практических занятий, а также ряд наглядных пособий для их успешного проведения. В послевоенный период методическая работа значительно возросла.
В 2010 году кафедра была переименована в кафедру эпидемиологии и доказательной медицины.
С 2009 г. по наст время кафедрой заведует Заслуженный деятель науки РФ, Академик РАН, д.м.н., профессор, Главный эпидемиолог МЗ РФ Брико Николай Иванович.