Отдел клинической фармакологии, основанный в 1972 году,  по праву считается "родоначальником" кафедры, ставшей первой кафедрой клинической фармакологии в СССР. С момента создания и по сентябрь 2017 года её возглавлял академик РАН, заслуженный деятель науки, почетный заведующий кафедрой, доктор медицинских наук - профессор Владимир Григорьевич Кукес. В настоящий момент заведующей кафедрой клинической фармакологии и пропедевтики внутренних болезней является доктор медицинских наук, профессор Ших Евгения Валерьевна.

Педагогическая, лечебная и научная работа - главные составляющие жизни кафедры, обучение на которой в настоящий момент проходят студенты лечебного, стоматологического, педиатрического факультетов, дирекции образовательных программ Международной школы "Медицина будущего", Центра международного образования. Кафедра клинической фармакологии и пропедевтики внутренних болезней составляет пул тех немногочисленных кафедр Сеченовского университета, что реализуют обучение  по различным учебным дисциплинам на протяжении всего периода обучения в вузе - от изучения основ ухода за больными на 1 курсе до погружения в мир клинической фармакологии на 6 году обучения. Кроме того, ежегодно в стенах кафедры проводится  элективный курс по актуальным вопросам фармакогенетики для студентов выпускных курсов. Преподавание  ведётся как на русском, так и на английском языках.  

Выпускники  могут продолжить получать медицинское образование на кафедре  путем прохождения программ клинической ординатуры (доступные направления: терапия и клиническая фармакология) и аспирантуры (клиническая фармакология и внутренние болезни). 

Клинической базой  кафедры является городская клиническая больница им.И.В Давыдовского ДЗМ (ул. Яузская, д.11, корп.5). В условиях терапевтического, кардиологического, пульмонологического и неврологического отделений осуществляется регулярная консультативная и лечебная  деятельность сотрудников кафедры, проводятся практические занятия со студентами. 

Основными направлениями научной работы кафедры являются:

  • Изучение системы биотрансформации и транспортеров лекарственных средств с целью повышения эффективности и безопасности применения лекарственных средств.
  • Фармакогенетические исследования: изучение полиморфизмов генов изоферментов цитохрома Р-450 и транспоптреров лекарственных средств и их влияние на эффективность и безопасность лекарственных средств.
  • Фармакоэпидемиологические и фармакоэкономические исследования (сердечно-сосудистые заболевания, заболевания органов дыхания, желудочно-кишечного тракта, остеопороз и т.д.).
  • Клинические исследования лекарственных средств у больных с хронической сердечной недостаточностью, артрериальной гипертензией, гиперлипидемиями, язвенной болезнтю желудка и 12-перстной кишки, бронхиальной астмой.
  • Изучение фармакокинетики, фармакодинамики, клинической эффективности и безопасности витаминных препаратов.
  • Клинические исследования эффективности и безопасности гомеопатических и фитопрепаратов.
  • Фармакокинетические исследования лекарственных средств.